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外泌体测序技术服务

外泌体作为活细胞分泌的含有RNA 和蛋白质的微囊泡,直径为 30-150nm之间,广泛分布于外周血、尿液、唾液、腹水、羊水等多种体液中。最新研究表明,外泌体包含多种活性分子,如蛋白质、脂肪和核酸(mRNA、miRNA 及其它非编码RNA )  等, 能作为信号分子传递给靶细胞,介导细胞间的物质传递与信息交流,文献报道体液中外泌体 RNA  (特别是miRNA 等非编码RNA)在不同的疾病模型中存在明显的表达差异。同时,这些分子被外泌体的脂膜所包裹和保护, 能保持其原有稳定性和生物学功能, 已经成为液体活检的重要分子标志物。近年来, 外泌体已成为科研热点,其在临床上巨大的应用价值, 引起了众多研究者以及商业人士的浓厚兴趣。随着相关技术的发展, 有关外泌体在临床疾病(尤其是肿瘤)的早期诊断、治疗、预后及伴随诊断的应用研究正在蓬勃开展。通过高通量技术对外泌体 RNA进行测序, 可快速高效获得外泌体RNA 的全面信息,是疾病诊断和随访的理想手段。

 

    样本要求

    测序策略

    交付周期

    样品类型: Total RNA、细胞上清、血液、尿液等

    样品浓度: ≥5ng/μl,细胞上清≥30ml,血液≥4ml

    样品总量: ≥30ng

    测序模式Illumina Hiseq Nova/MGISEQ T7    PE150

    测序深度10-18G clean data/20M reads

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    1、建库超低起始量,最低建库起始量可以达到1ng 总RNA。
    2、成熟的外泌体分离及外泌体R NA提取技术。
    3、丰富的项目经验涵盖外泌体 miRNA、lncRNA 、circRNA 测序。
    4、测序数据 Mapping比例高,测序数据量和质量有保证。
    5、外泌体中 rRNA去除率高,有效数据比例高。


注:分离外泌体前的样品不能加入任何RNA保护剂(如TRIzol,RNAlater);血清,血浆,外泌体等样品属于特殊样品,提取风险较大,迈斯普不承诺提取的成功率。其他特殊样品请与销售或技术支持联系。


      研究案例:

    健康及癌症病人血浆中胞外囊泡的RNA表达谱研究

    研究背景:

    胞外囊泡会选择性包装RNA,可以作为潜在疾病生物标志物。研究通过对血浆胞外囊泡中的RNA进行测序分析,来挖掘具有生物标识物潜力的RNA。

    研究内容:

    为了系统地描述循环系统RNA(exRNA)表达情况。我们对来源于50名健康个体和142名癌症患者血浆的胞外囊泡进行了RNA测序分析,每个样本测序深度约1260万原始测序读长。

    研究结果:

    Mapping处理发现约540万个RNA,包括微RNA(约40.4%),piRNAs(约40.0%),lncRNAs(约2.4%),tRNA(约2.1%)和mRNA(约2.1%);

    通过表达稳定性分析,研究发现了一组miRNA在不同的样本中有相对一致的表达丰度;

    通过协方差多因素分析,研究发现exRNAs与年龄,性别和不同类型的癌症显著的相关。下调的miR-125a-5p和miR-1343-3p显示出与所有测试的癌症类型的关联(FDR<0.05);

    研究为exRNA提供了一些基准参考信息,同时也发现了具有成为生物标识物潜力的RNA。

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    1. 转录组分析外泌体中RNA的种类



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