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详细内容

转座子突变体文库筛选技术服务

一、技术背景:

       受限于二代测序高昂的成本,对于已经构建了细菌/真菌/植物转座子突变体文库的客户,常常因为无其他高效鉴定方法而导致无法大规模进行后续功能筛选实验。而突变体库筛选的工作又非常重要。怎样高效低廉地筛选突变体库的方法,显得尤为重要。对此,我公司开发Cubes-seq专利技术,可以在短时间内对成千上万份样本的插入位点进行鉴定检测,确定突变体文库的遗传背景,利于后续实验的顺利开展。极大降低检测成本,非常适合大批量样品。技术原理如下:

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二、技术应用及特色:

1、插入片段突变体库鉴定,如TnT突变体库转基因材料的插入位点鉴定;

2、周期稳定,批量样品3-4周可出数据;

3、检出率高,准确度超90%;

4、极大降低检测费用,非常适合大批量样品,成本低。

 

三、突变体库筛选各项技术比对:


Cubes-seq法

TAIL PCR

染色体步移

二代测序

周期

批量样本3~4周

无法批量,周期不确定

无法批量,周期不确定

4周左右

准确性

检出率高,准确度超90%

准确性差,检出率低,尤其针对多拷贝插入

准确性差,检出率低,尤其针对多拷贝插入

检出率高

费用

适合大批量样本成本低

重复性差无法批量,试剂,人力成本高

重复性差无法批量试剂,人力成本高

费用最高

 


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